業務内容
募集の背景、プロジェクトの説明
加齢は全身で一様に進むのではなく、脳、免疫系、心血管系、肝臓など、臓器ごとに異なる速度で進行します。血液中には各臓器や細胞の状態を反映する多数のタンパク質が含まれており、血漿プロテオミクスとAIを組み合わせることで、臓器ごとの生物学的年齢や機能低下を非侵襲的に評価できる可能性があります。
本プロジェクトでは、OlinkおよびSomaScanによって取得された大規模血漿プロテオミクスデータを統合し、アジア人集団にも適用可能な「臓器年齢」および「臓器age gap」の評価・予測アルゴリズムを開発します。臓器age gapとは、AIが推定した臓器の生物学的年齢と暦年齢との差を示し、臓器の老化が平均より進んでいるか、あるいは若く保たれているかを定量化する指標です。
既存の臓器年齢モデルは、主に欧米人コホートと特定の測定プラットフォームに基づいています。そのため、アジア人集団における再現性や、OlinkとSomaScanの測定基盤の違いを越えたモデルの汎用性は、十分に確立されていません。
本研究では、正則化回帰、勾配ブースティング、ドメイン較正、SHAPなどの機械学習・説明可能AI技術を用いて、測定プラットフォーム差や集団差に頑健なモデルを構築します。さらに、予測に寄与するタンパク質を、炎症、ミトコンドリア、細胞老化、クロマチン制御、細胞外マトリックスなどの老化関連分子経路と結びつけます。
最終的には、老化状態の可視化、健康リスク評価、介入標的の探索、個人の生体状態を再現する分子デジタルツインの構築につながる研究基盤の確立を目指します。
仕事内容・職務内容
研究代表者および共同研究者と連携し、主に以下の業務を担当していただきます。
- Olink、SomaScanを中心とする血漿プロテオミクスデータの整理、品質管理、前処理
- タンパク質ID、測定単位、欠測値、老化、性別、採血条件などのメタデータ統合
- OlinkとSomaScan間の共通タンパク質マッピングおよびプラットフォーム較正
- GTExなどの公開データを利用した臓器特異的タンパク質のアノテーション
- LASSO、Elastic Net、勾配ブースティングなどを用いた臓器年齢予測モデルの構築
- train／test分割、leave-one-cohort-out、leave-one-platform-out解析によるモデルの外部検証
- MAE、R²、級内相関、順位相関、較正誤差などを用いたモデル性能評価
- SHAP、回帰係数、ネットワーク解析などを用いた臓器別寄与タンパク質の同定
- 老化、炎症、ミトコンドリア、クロマチン、ECMなどの分子シグネチャーとの統合解析
- ICEマウス、単一細胞データ、公開トランスクリプトームデータを用いた生物学的解釈
- 解析パイプライン、コード、メタデータ仕様書、解析プロトコルの整備
- 研究成果の可視化、報告書・学会発表資料・学術論文の作成
- 研究ミーティングへの参加および生命科学研究者、情報科学研究者との共同研究
本ポジションでは、既存データの解析だけでなく、「臓器老化をどのように数値化するか」「異なる測定技術から得られたデータをどう統合するか」「AIが選択したタンパク質を老化メカニズムとしてどう解釈するか」といった、生命科学とデータサイエンスの境界領域に取り組んでいただきます。
配属部署
既設部署
研究推進機構総合研究院 老化分子生物学寄附研究部門
職種
研究員・ポスドク相当
研究分野
情報通信 - 生命、健康、医療情報学
給与
年収 : 400万円 ～ 700万円
勤務時間
就業時間 : 09:00-18:00
休憩時間 : 12:00-13:00
休日 : 週休二日制
時間外勤務、その他説明 : 裁量労働制を適用し、研究計画に応じて適宜対応可
募集要項
応募資格
応募に必要な学歴・学位
博士
説明
- 生物学、医学に関連する博士の学位もしくは同等の業績をお持ちの方
- 学位を取得済み、もしくは学位取得見込みの方。
- 分子生物学、細胞生物学に詳しく、動物実験の経験がある方。
- 老化研究に興味があり、解析結果を生かした創薬研究に興味がある方。
雇用形態
正職員・正社員
契約期間
任期あり - テニュアトラック以外
任期1年。年度更新。
試用期間あり
３か月
勤務地
〒278-8510
千葉県
野田市山崎2641 東京理科大学
野田キャンパス10 号館 3 階
待遇
各種制度
昇給制度 : あり
通勤交通費支給制度 : あり
加入保険
健康保険 : あり
厚生年金保険 : あり
労災保険 : あり
雇用保険 : あり
応募上の配慮
採用人数
2名
募集期間
2026年08月14日~2026年12月31日 必着
応募方法
応募書類
履歴書 : 電子応募
業績リスト : 電子応募
応募書類の返却
応募書類はすべて当方にて責任を持って廃棄いたします。
JREC-IN Portal Web応募 : 可
電子メール応募 : 可
mhayano(at)rs.tus.ac.jp
- (at)を@に変更して送信してください。
求人機関Web応募 : 不可
公募のURL
選考・結果通知
選考内容
履歴書（CV）およびカバーレターを、下記連絡先までお送りください。カバーレターには、当研究室の老化研究に興味を持った理由をご記載ください。書類選考のうえ、面接を実施いたします。
カバーレターには、以下の事項を必ず含めてください。
- 研究に取り組む動機
- 老化研究分野への関心・興味
結果通知方法
類選考のうえ、面接をさせていただきます。面接日程は、対象者に１週間以内に別途連絡します。
連絡先
東京理科大学
研究推進機構総合研究院 老化分子生物学寄附研究部門
早野 元詞
0471241501
mhayano(at)rs.tus.ac.jp
- (at)を@に変更して送信してください。
